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题：在坏死性小肠结肠炎发生之前，肠道细菌复制加速，克雷伯菌属和菌毛编码相关细菌的丰度增加。
坏死性小肠结肠炎（Necrotizingenterocolitis,NEC）影响美国7%的超低体重儿。其病死率在过去的几十年都高达20%-30%。但关于NEC的发病机制目前仍不清楚。
NEC的主要危险因素是早产。在面对肠道细菌入侵时，未成熟的肠道上皮细胞通过Toll样受体4表现出超强的免疫反应（尤其针对LPS），造成严重肠道上皮损害。实验发现肠道菌群能够影响NEC的致病过程，但没有一个单一菌种能够作为诊断NEC的生物标志物。
本研究通过宏基因组手段，对个肠道粪便标本进行测序分析，以期发现NEC的一些生物标志物，供临床医生作参考。技术路线如下：
▲图1本研究技术路线
与对照组（非NEC婴儿）相比，NEC婴儿肠道的肠杆菌科细菌（Enterobacteriaceae）的丰度较高，而放线菌门（Actinobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和厚壁菌门（Firmicutes）的丰度较低（图2）。▲图2NEC婴儿和非NEC婴儿肠道菌群的组成
通过训练机器学习分类器，发现在诊断NEC之前2天，肠道细菌（尤其是肠杆菌科细菌）的复制速率显著增加（图3）。▲图3诊断NEC之前，细菌的复制速率显著较高
此外，细菌菌毛相关的基因簇，在克雷伯菌属中的所占比例最高，而这与NEC的发病直接相关（图4）。▲图4菌毛相关基因簇在各属水平的分布
总的来说，在诊断前8天内，NEC组的次级代谢物基因簇和克雷伯菌属每天都显著高于对照组（图5）。这些指标或许能够为NEC的发作提供临床参考。▲图5各类生物标志物在NEC发病过程中（诊断前8天内）的变化
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