今天是第期日报。
Nature:“众包”的地球微生物组计划硕果累累Nature[IF:40.]
①年启动的地球微生物组计划的首批成果发布,40多个国家的多名研究者参与其中,已有超过60篇相关文献发表;②首批成果分析了来自7个大陆、43个国家、17种不同环境的余份环境样本中的细菌及古细菌;③分别来自于宿主相关环境(动物肠道、动物分泌物/体表/组织、植物)及自由生活环境(含盐环境、非盐水、非盐沉积物/土壤/表面/气溶胶);④研究也有缺陷:基于DNA提取的方法可能在不同样本中造成偏差、缺少假设驱动的实验设计。
CrowdsourcingEarth’smicrobes
-11-01DOI:10./nature
Nature:地球微生物组计划的阶段性成果Nature[IF:40.]
①相比于自由生活环境(含盐/非盐环境),宿主相关环境(动物/植物)中微生物丰度降低,植物根系是个例外,根系菌群与土壤菌群类似;②利用机器学习方法根据微生物组成区分样本来源,准确率91%,土壤、非盐表面、气溶胶、动物分泌物中的微生物较难区别;③微生物群落丰度与pH值及温度相关,中性pH值和10℃下,微生物丰度最高;④群落的β多样性由turnover(分类群的更替)及嵌套性(获得或失去分类群导致丰度变化)驱动,后者占主导地位。